178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1745 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1745  Potassium-transporting ATPase  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1015  potassium-transporting ATPase  45.21 
 
 
187 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.726831  normal  0.400726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.02 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.64 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3785  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  46.85 
 
 
174 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.532283  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  46.15 
 
 
201 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  41.4 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4240  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.9 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  43.1 
 
 
206 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  41.67 
 
 
205 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.57 
 
 
193 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  38.66 
 
 
192 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  40.72 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.62 
 
 
191 aa  121  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.76 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1192  potassium-transporting ATPase subunit C  38.95 
 
 
199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  41.99 
 
 
180 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  39.67 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  36.02 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  44.81 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  41.24 
 
 
201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3080  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.77 
 
 
199 aa  118  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  41.67 
 
 
201 aa  117  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  42.68 
 
 
192 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  42.11 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1973  potassium-transporting ATPase subunit C  36.7 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  38.92 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  43.51 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  39.11 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  33.51 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.46 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  40.46 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  38.04 
 
 
189 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  40.54 
 
 
193 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  40.54 
 
 
193 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  40.54 
 
 
193 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.1 
 
 
190 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  41.45 
 
 
201 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  39.34 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  35.05 
 
 
191 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  40.74 
 
 
201 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  38.71 
 
 
207 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  35.05 
 
 
191 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  43.51 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.51 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  39.29 
 
 
206 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.65 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1157  potassium-transporting ATPase subunit C  43.29 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.484246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  45.91 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1104  potassium-transporting ATPase subunit C  43.29 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.58934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3580  potassium-transporting ATPase subunit C  43.29 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  42.21 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.36 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3602  potassium-transporting ATPase, C subunit  43.4 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2506  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.7 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.318419  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  37.23 
 
 
189 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0951  potassium-transporting ATPase subunit C  37.63 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  44.87 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  38.92 
 
 
191 aa  111  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  43.04 
 
 
193 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4159  potassium-transporting ATPase subunit C  39.53 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411007  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0253  Potassium-transporting ATPase  40 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1709  potassium-transporting ATPase subunit C  39.53 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1512  potassium-transporting ATPase, C subunit  42 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  38.66 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2049  potassium-transporting ATPase subunit C  37.29 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0553231  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  39.01 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3971  potassium-transporting ATPase subunit C  38.38 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0485598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  35.64 
 
 
198 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2485  potassium-transporting ATPase subunit C  32.47 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0061  potassium-transporting ATPase subunit C  32.47 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0063  potassium-transporting ATPase subunit C  32.47 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  37.11 
 
 
218 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.22 
 
 
189 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3614  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.46 
 
 
187 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  hitchhiker  0.000228688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2929  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.04 
 
 
191 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.531992  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4548  potassium-transporting ATPase subunit C  40.99 
 
 
199 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  41.56 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0723  potassium-transporting ATPase, C subunit  35.79 
 
 
194 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3246  potassium-transporting ATPase, C subunit  34.76 
 
 
198 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0379  potassium-transporting ATPase subunit C  35.16 
 
 
186 aa  105  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00405632  normal  0.0357921 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.17 
 
 
189 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2486  Potassium-transporting ATPase  42.95 
 
 
186 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.436876  normal  0.0861404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  43.84 
 
 
811 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  39.58 
 
 
190 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2244  potassium-transporting ATPase, C subunit  36.16 
 
 
190 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.081737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  37.62 
 
 
233 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.01 
 
 
197 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1984  potassium-transporting ATPase subunit C  32.97 
 
 
186 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0143266  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  33.51 
 
 
202 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0626  potassium-transporting ATPase subunit C  34.24 
 
 
192 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0289  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.86 
 
 
216 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.238341 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>