178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2485 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2485  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0061  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0063  potassium-transporting ATPase subunit C  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2112  potassium-transporting ATPase subunit C  52.43 
 
 
186 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.477514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2150  potassium-transporting ATPase subunit C  52.43 
 
 
186 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.995034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1212  potassium-transporting ATPase subunit C  43.65 
 
 
198 aa  147  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.152456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0896  potassium-transporting ATPase subunit C  42.02 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.217239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4647  potassium-transporting ATPase subunit C  41.12 
 
 
206 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0811  potassium-transporting ATPase subunit C  42.02 
 
 
193 aa  143  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.700672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0656  potassium-transporting ATPase subunit C  42.02 
 
 
193 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2324  potassium-transporting ATPase subunit C  40.61 
 
 
193 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2992  potassium-transporting ATPase subunit C  40.1 
 
 
205 aa  141  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.575111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4532  potassium-transporting ATPase subunit C  41.49 
 
 
193 aa  141  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.366461  normal  0.330435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3237  potassium-transporting ATPase subunit C  40.31 
 
 
201 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.433479  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11049  potassium-transporting ATPase subunit C  41.58 
 
 
189 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0799  potassium-transporting ATPase subunit C  42.55 
 
 
193 aa  140  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5838  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.88 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.217383  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0705  potassium-transporting ATPase subunit C  40.96 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0741  potassium-transporting ATPase subunit C  40.96 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367102  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2309  potassium-transporting ATPase subunit C  42.13 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5613  potassium-transporting ATPase subunit C  40.61 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0011063  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0817  potassium-transporting ATPase subunit C  40.43 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.75663e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0649  potassium-transporting ATPase subunit C  40.43 
 
 
193 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0648  potassium-transporting ATPase subunit C  40.43 
 
 
193 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.109219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1674  potassium-transporting ATPase subunit C  41.97 
 
 
193 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2286  potassium-transporting ATPase subunit C  41.97 
 
 
193 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0196  potassium-transporting ATPase subunit C  40.61 
 
 
201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.054482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1246  potassium-transporting ATPase subunit C  41.92 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3778  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.06 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.962819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1023  potassium-transporting ATPase subunit C  40.72 
 
 
193 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0235  potassium-transporting ATPase subunit C  39.59 
 
 
201 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1310  potassium-transporting ATPase subunit C  41.97 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1933  potassium-transporting ATPase subunit C  43.89 
 
 
191 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1960  potassium-transporting ATPase subunit C  43.89 
 
 
191 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.449884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2278  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.03 
 
 
193 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6750  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.79 
 
 
189 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726202  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1887  Potassium-transporting ATPase  40.1 
 
 
218 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2202  potassium-transporting ATPase subunit C  43.26 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29676  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3250  potassium-transporting ATPase subunit C  39.29 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3493  hypothetical protein  37.3 
 
 
180 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1873  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.69 
 
 
191 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0206  potassium-transporting ATPase subunit C  40.1 
 
 
201 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0040  potassium-transporting ATPase subunit C  39.49 
 
 
203 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0992  potassium-transporting ATPase subunit C  39.38 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1098  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.9 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0055  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.95 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3411  potassium-transporting ATPase subunit C  40 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0626  potassium-transporting ATPase subunit C  39.25 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0512  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.84 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00499959  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2382  potassium-transporting ATPase  38.27 
 
 
233 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858368  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0664  potassium-transporting ATPase subunit C  39.49 
 
 
201 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6072  K+-transporting ATPase C subunit  37.17 
 
 
191 aa  130  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3591  potassium-transporting ATPase subunit C  39.38 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018979  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2482  potassium-transporting ATPase, C subunit  40.4 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4993  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.9 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2606  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.38 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3269  potassium-transporting ATPase subunit C  39.38 
 
 
207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24892  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1128  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.8 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1874  potassium-transporting ATPase subunit C  41.48 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2291  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  37.82 
 
 
206 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0738481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1395  potassium-transporting ATPase subunit C  41.48 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.297713  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2100  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.67 
 
 
207 aa  128  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1085  potassium-transporting ATPase subunit C  41.48 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.165884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0782  potassium-transporting ATPase subunit C  41.48 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.489303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1243  potassium-transporting ATPase subunit C  41.48 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1251  potassium-transporting ATPase subunit C  41.48 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0368  potassium-transporting ATPase subunit C  41.48 
 
 
193 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2473  K+-transporting ATPase, C subunit  41.67 
 
 
207 aa  128  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.469372  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1668  potassium-transporting ATPase subunit C  40.93 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2824  potassium-transporting ATPase subunit C  37.82 
 
 
200 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0862  potassium-transporting ATPase subunit C  37.95 
 
 
194 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2215  potassium-transporting ATPase subunit C  42.19 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3384  potassium-transporting ATPase subunit C  38.02 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1887  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.99 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.201201 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2234  K+-transporting ATPase, C subunit  41.99 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1085  potassium-transporting ATPase subunit C  38.19 
 
 
191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0951803  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0357  potassium-transporting ATPase, C subunit  38.34 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.029609 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0701  potassium-transporting ATPase, C subunit, putative  35.18 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3780  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.56 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0826  potassium-transporting ATPase subunit C  37.44 
 
 
194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0159409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1225  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.63 
 
 
189 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3846  potassium-transporting ATPase subunit C  39.57 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0789  potassium-transporting ATPase subunit C  38.69 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0718  potassium-transporting ATPase subunit C  39.2 
 
 
190 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0180  potassium-transporting ATPase subunit C  37.06 
 
 
201 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.923955 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0253  Potassium-transporting ATPase  34.54 
 
 
197 aa  124  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  42.37 
 
 
811 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2505  K+ transporting ATPase C chain  42.29 
 
 
191 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0765  potassium-transporting ATPase subunit C  37.24 
 
 
194 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0812  potassium-transporting ATPase subunit C  37.24 
 
 
194 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112771  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0752  potassium-transporting ATPase subunit C  37.24 
 
 
194 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0723  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.43 
 
 
194 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2435  K+ transporting ATPase, KdpC subunit  37.44 
 
 
189 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324583  normal  0.873018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1481  potassium-transporting ATPase, C subunit  39.88 
 
 
205 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0065  potassium-transporting ATPase, C subunit  37.82 
 
 
202 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0743  potassium-transporting ATPase subunit C  38.69 
 
 
190 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2089  potassium-transporting ATPase, C subunit  41.08 
 
 
195 aa  123  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0776  potassium-transporting ATPase, C subunit, putative  34.17 
 
 
202 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.742863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1192  potassium-transporting ATPase subunit C  37.89 
 
 
199 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2055  potassium-transporting ATPase subunit C  35.57 
 
 
193 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.792846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>