104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0937 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0009  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0077  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0274  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0329  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.627397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0643  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1057  IstB ATP binding domain-containing protein  96.84 
 
 		 633 bp  1088    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1137  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1280  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.601601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1347  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.917439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1451  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.531328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1556  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0817165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1752  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  93.4 
 
 		 924 bp  1344    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2042  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000174338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2111  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  94.07 
 
 		 867 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2173  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  96.08 
 
 		 1572 bp  1407    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2210  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2308  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2320  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000045889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2383  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2567  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0579264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2652  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2659  IstB ATP binding domain-containing protein  91.34 
 
 		 837 bp  1039    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0119  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 813 bp  1612    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0120    100 
 
 		 1577 bp  1669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0230  IstB domain protein ATP-binding protein  98.49 
 
 		 774 bp  1350    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.872144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1575 bp  1669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0717  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 813 bp  1612    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.254049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    100 
 
 		 4766 bp  9448    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    100 
 
 		 2917 bp  5783    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  100 
 
 		 921 bp  1826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0941    100 
 
 		 836 bp  1657    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000821744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  98.7 
 
 		 921 bp  1731    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  97.43 
 
 		 777 bp  1314    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  99.35 
 
 		 924 bp  1780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1865    100 
 
 		 1576 bp  1669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1866    99.88 
 
 		 814 bp  1598    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00102659  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  100 
 
 		 921 bp  1826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  99.35 
 
 		 924 bp  1780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2102    99.25 
 
 		 1173 bp  1265    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.068198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2103    99.51 
 
 		 814 bp  1574    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.431767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2104    99.76 
 
 		 1576 bp  1647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2733    86.87 
 
 		 1572 bp  781    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2734    87.16 
 
 		 837 bp  743    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0584    90.02 
 
 		 776 bp  632  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  99.66 
 
 		 294 bp  575  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  99.32 
 
 		 294 bp  567  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1059    95.91 
 
 		 306 bp  446  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  99.55 
 
 		 228 bp  436  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2408    87.59 
 
 		 486 bp  398  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0780  IstB ATP binding domain-containing protein  89.44 
 
 		 528 bp  369  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1058    95.89 
 
 		 222 bp  363  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0022    95.65 
 
 		 231 bp  339  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  82.87 
 
 		 804 bp  317  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0158    88.42 
 
 		 423 bp  303  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0583  transposase IS3/IS911 family protein  90.67 
 
 		 207 bp  232  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1092    88.89 
 
 		 171 bp  145  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.534826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  85.43 
 
 		 795 bp  125  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0121    100 
 
 		 342 bp  113  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  94.74 
 
 		 822 bp  89.7  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1753  YapH protein  95.92 
 
 		 540 bp  81.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0330    95.74 
 
 		 249 bp  77.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.523159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2651  hypothetical protein  95.74 
 
 		 270 bp  77.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  87.67 
 
 		 828 bp  73.8  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  100 
 
 		 882 bp  58  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  85.71 
 
 		 720 bp  54  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 978 bp  52  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  92.11 
 
 		 285 bp  52  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>