10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0121 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0121    100 
 
 		 342 bp  678    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  84.44 
 
 		 309 bp  202  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  84.76 
 
 		 324 bp  127  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    100 
 
 		 4766 bp  113  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2657  hypothetical protein  94.74 
 
 		 822 bp  89.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  80 
 
 		 321 bp  79.8  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1569  hypothetical protein  100 
 
 		 312 bp  61.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184826  unclonable  0.0000116524 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  81.63 
 
 		 336 bp  52  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  81.63 
 
 		 336 bp  52  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0715  hypothetical protein  100 
 
 		 144 bp  46.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>