31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2733 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2733    100 
 
 		 1572 bp  3116    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2104    85 
 
 		 1576 bp  1150    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1865    84.87 
 
 		 1576 bp  1120    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    86.87 
 
 		 2917 bp  781    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    86.87 
 
 		 4766 bp  781    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  85.06 
 
 		 1575 bp  1164    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0120    84.94 
 
 		 1577 bp  1136    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  85.48 
 
 		 1572 bp  1243    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  85.48 
 
 		 1572 bp  1243    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  85.55 
 
 		 1572 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0022    85.02 
 
 		 231 bp  165  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1059    79.91 
 
 		 306 bp  89.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1058    87.21 
 
 		 222 bp  83.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>