29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0022 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0022    100 
 
 
231 bp  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1865    95.65 
 
 
1576 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    95.65 
 
 
2917 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    95.65 
 
 
4766 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  95.65 
 
 
1575 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0120    95.65 
 
 
1577 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  95.65 
 
 
1572 bp  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2104    95.19 
 
 
1576 bp  325  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2733    85.02 
 
 
1572 bp  165  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>