65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0938 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0938    100 
 
 		 2917 bp  5783    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0120    100 
 
 		 1577 bp  1669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  100 
 
 		 1575 bp  1669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    100 
 
 		 4766 bp  5783    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  100 
 
 		 921 bp  1826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  98.7 
 
 		 921 bp  1731    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  97.43 
 
 		 777 bp  1314    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  99.35 
 
 		 924 bp  1780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1865    100 
 
 		 1576 bp  1669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  100 
 
 		 921 bp  1826    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  99.35 
 
 		 924 bp  1780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2102    99.25 
 
 		 1173 bp  1265    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.068198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2104    99.76 
 
 		 1576 bp  1647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2733    86.87 
 
 		 1572 bp  781    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  93.4 
 
 		 924 bp  1344    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 		 1572 bp  1423    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  94.07 
 
 		 867 bp  1251    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  96.08 
 
 		 1572 bp  1407    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0584    90.02 
 
 		 776 bp  632  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 294 bp  583  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  99.66 
 
 		 294 bp  575  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  99.32 
 
 		 294 bp  567  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  98.3 
 
 		 294 bp  543  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1059    95.91 
 
 		 306 bp  446  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  99.55 
 
 		 228 bp  436  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1058    95.89 
 
 		 222 bp  363  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0022    95.65 
 
 		 231 bp  339  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0583  transposase IS3/IS911 family protein  90.67 
 
 		 207 bp  232  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1092    88.89 
 
 		 171 bp  145  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.534826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  87.67 
 
 		 828 bp  73.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  84 
 
 		 927 bp  71.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  100 
 
 		 882 bp  58  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  85.71 
 
 		 720 bp  54  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 978 bp  52  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  92.11 
 
 		 285 bp  52  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  92.11 
 
 		 285 bp  52  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  92.11 
 
 		 285 bp  52  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2501  hypothetical protein  96.55 
 
 		 288 bp  50.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.990721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2881    96.55 
 
 		 474 bp  50.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>