15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0584 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0584    100 
 
 		 776 bp  1538    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  91.94 
 
 		 921 bp  720    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  90.72 
 
 		 924 bp  668    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  90.72 
 
 		 924 bp  668    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2102    90.19 
 
 		 1173 bp  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.068198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    90.02 
 
 		 4766 bp  632  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    90.02 
 
 		 2917 bp  632  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  90.02 
 
 		 921 bp  632  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  90.02 
 
 		 921 bp  632  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  93.77 
 
 		 777 bp  537  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  86.16 
 
 		 924 bp  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  85.65 
 
 		 867 bp  357  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1092    90.57 
 
 		 171 bp  188  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.534826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  85.92 
 
 		 828 bp  61.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  78.82 
 
 		 978 bp  52  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>