24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2102 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  92.53 
 
 		 924 bp  910    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2102    100 
 
 		 1173 bp  2325    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.068198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  99.1 
 
 		 924 bp  1259    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  99.25 
 
 		 921 bp  1265    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  99.1 
 
 		 924 bp  1259    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  95.87 
 
 		 777 bp  785    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  98.05 
 
 		 921 bp  1201    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  99.25 
 
 		 921 bp  1265    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    99.25 
 
 		 2917 bp  1265    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    99.25 
 
 		 4766 bp  1265    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0584    90.19 
 
 		 776 bp  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  93.18 
 
 		 867 bp  809    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1092    89.63 
 
 		 171 bp  153  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.534826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  87.67 
 
 		 828 bp  73.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  100 
 
 		 882 bp  58  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  85.71 
 
 		 720 bp  54  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 927 bp  54  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 927 bp  54  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 927 bp  54  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  96.77 
 
 		 927 bp  54  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 		 978 bp  52  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1207  hypothetical protein  91.89 
 
 		 177 bp  50.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2501  hypothetical protein  96.55 
 
 		 288 bp  50.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.990721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2881    96.55 
 
 		 474 bp  50.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>