26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2881 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2881    100 
 
 		 474 bp  940    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 288 bp  571  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.990721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  94 
 
 		 828 bp  75.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  92.31 
 
 		 837 bp  54  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 156 bp  52  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.757494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 921 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 927 bp  50.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 927 bp  50.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 927 bp  50.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 927 bp  50.1  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2102    96.55 
 
 		 1173 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.068198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 924 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 924 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 921 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  96.55 
 
 		 921 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    96.55 
 
 		 2917 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    96.55 
 
 		 4766 bp  50.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  93.94 
 
 		 720 bp  50.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5293  transposase (class III)  90 
 
 		 201 bp  48.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.923099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  90 
 
 		 828 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  96.43 
 
 		 867 bp  48.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  91.67 
 
 		 891 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  96.43 
 
 		 924 bp  48.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1836  hypothetical protein  96.3 
 
 		 276 bp  46.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>