More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5293 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5293  transposase (class III)  100 
 
 
66 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.923099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  74.24 
 
 
236 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  77.05 
 
 
296 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  77.05 
 
 
296 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  77.05 
 
 
296 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  75.86 
 
 
293 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  72.13 
 
 
239 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  74.14 
 
 
245 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  70.69 
 
 
290 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  70.69 
 
 
290 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  70.69 
 
 
276 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  63.08 
 
 
217 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  63.08 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  70.91 
 
 
257 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  63.08 
 
 
191 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  68.97 
 
 
208 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  68.97 
 
 
222 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  65.52 
 
 
275 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  65.52 
 
 
275 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  67.24 
 
 
233 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  69.81 
 
 
275 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  63.79 
 
 
278 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  64.41 
 
 
308 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  68.97 
 
 
276 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  65.57 
 
 
275 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  64.41 
 
 
308 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  64.41 
 
 
308 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  64.41 
 
 
308 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 
275 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 
275 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 
275 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 
275 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
262 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
262 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
262 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
262 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1836  hypothetical protein  61.29 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  60.66 
 
 
307 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  64.81 
 
 
288 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  67.31 
 
 
307 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  67.31 
 
 
258 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  67.31 
 
 
307 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  67.31 
 
 
306 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  65.38 
 
 
306 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  65.38 
 
 
306 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  64.29 
 
 
325 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3028  integrase catalytic subunit  58.62 
 
 
245 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6988  Integrase catalytic region  59.68 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  56.25 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  56.36 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  55.17 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  46.55 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  50 
 
 
305 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1412  Integrase catalytic region  47.37 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000825692  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  48.28 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  48.28 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  48.28 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  48.28 
 
 
279 aa  64.3  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2620  hypothetical protein  47.17 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.452433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  39.39 
 
 
295 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2103  Integrase catalytic region  47.17 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  48.33 
 
 
290 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 
382 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 
382 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 
382 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 
382 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>