More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2501 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.990721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  67.65 
 
 		 307 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  67.65 
 
 		 288 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  66.18 
 
 		 258 aa  103  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  66.18 
 
 		 307 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  66.18 
 
 		 306 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  66.18 
 
 		 307 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  67.65 
 
 		 275 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  69.12 
 
 		 278 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  63.24 
 
 		 217 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  64.71 
 
 		 306 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  64.71 
 
 		 306 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  63.24 
 
 		 208 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  63.24 
 
 		 233 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  63.24 
 
 		 233 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  63.24 
 
 		 191 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  66.18 
 
 		 293 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  63.24 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  61.76 
 
 		 290 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  61.76 
 
 		 290 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  63.24 
 
 		 222 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  64.71 
 
 		 257 aa  98.6  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  63.24 
 
 		 275 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  63.24 
 
 		 275 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  65.62 
 
 		 172 aa  97.4  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  63.77 
 
 		 308 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  63.77 
 
 		 308 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  63.77 
 
 		 308 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  63.77 
 
 		 308 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  58.82 
 
 		 239 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  61.76 
 
 		 236 aa  94.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  62.69 
 
 		 280 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  60.29 
 
 		 325 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  55.88 
 
 		 245 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6988  Integrase catalytic region  63.24 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.870361 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  58.82 
 
 		 296 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  58.82 
 
 		 296 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  58.82 
 
 		 296 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  59.7 
 
 		 278 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  57.35 
 
 		 276 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2620  hypothetical protein  56.72 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.452433  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1836  hypothetical protein  55.88 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  60.29 
 
 		 262 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  60.29 
 
 		 262 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  58.21 
 
 		 278 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  60.29 
 
 		 262 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  60.29 
 
 		 262 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  58.82 
 
 		 275 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3028  integrase catalytic subunit  63.93 
 
 		 245 aa  87  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  57.35 
 
 		 275 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  57.35 
 
 		 275 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  57.35 
 
 		 275 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  57.35 
 
 		 275 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  61.19 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  57.35 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  55.88 
 
 		 276 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2103  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.189866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1412  Integrase catalytic region  42.65 
 
 		 253 aa  77  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000825692  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  51.47 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  48.53 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  48.53 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  48.53 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  44.78 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>