12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1092 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1092    100 
 
 
171 bp  339  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.534826  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0584    90.57 
 
 
776 bp  188  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  91.11 
 
 
924 bp  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  91.11 
 
 
924 bp  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  89.63 
 
 
921 bp  153  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2102    89.63 
 
 
1173 bp  153  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.068198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    88.89 
 
 
4766 bp  145  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    88.89 
 
 
2917 bp  145  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  88.89 
 
 
921 bp  145  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  88.89 
 
 
921 bp  145  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  85.93 
 
 
924 bp  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  89.58 
 
 
867 bp  56  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>