31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2104 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2733    85 
 
 		 1572 bp  1150    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2104    100 
 
 		 1576 bp  3124    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1865    99.56 
 
 		 1576 bp  3041    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0938    99.76 
 
 		 2917 bp  1647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0937    99.76 
 
 		 4766 bp  1647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.544961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  99.87 
 
 		 1575 bp  3100    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0120    99.75 
 
 		 1577 bp  3073    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  94.46 
 
 		 1572 bp  2413    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  94.52 
 
 		 1572 bp  2420    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  94.52 
 
 		 1572 bp  2420    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  94.58 
 
 		 1572 bp  2428    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1059    95.91 
 
 		 306 bp  446  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1058    95.89 
 
 		 222 bp  363  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0022    95.19 
 
 		 231 bp  325  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>