62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0327 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  100 
 
 
207 aa  422  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  64.08 
 
 
216 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  64.08 
 
 
216 aa  279  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  62.14 
 
 
216 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  53.03 
 
 
259 aa  223  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  51.44 
 
 
258 aa  216  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  47.57 
 
 
212 aa  204  8e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  51.24 
 
 
203 aa  201  9e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  39.22 
 
 
209 aa  153  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  35.9 
 
 
207 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  34.19 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  34.27 
 
 
228 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  34.27 
 
 
193 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  31.58 
 
 
223 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  34.48 
 
 
224 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  29.52 
 
 
246 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  32.68 
 
 
204 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  33.58 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0170  hypothetical protein  32.17 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  32.64 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  35.18 
 
 
200 aa  99  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  30.39 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  33.57 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  34.03 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  35.44 
 
 
224 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  32.26 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  31.02 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  30.15 
 
 
214 aa  89  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  28.48 
 
 
238 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  29.59 
 
 
239 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  32.61 
 
 
253 aa  85.5  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  27.4 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  32.35 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  30.77 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  27.59 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  28.44 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.9 
 
 
655 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  28.65 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  33.58 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  27.66 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  24.57 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  34.78 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  27.33 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  27.57 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  30.5 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  25.5 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  25.5 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  25.5 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  27.42 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  26.2 
 
 
256 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  25.7 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  25.7 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2859  hypothetical protein  26.94 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  24.55 
 
 
261 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  24.73 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  28.65 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  22.35 
 
 
250 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  20.9 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  20.9 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  24.71 
 
 
236 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5696  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.63 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.226605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  27.67 
 
 
242 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>