59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3179 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  495  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  92.21 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  74.79 
 
 		 245 aa  363  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  53.24 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  45.26 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  43.97 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  42.8 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  44.77 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0437  hypothetical protein  44.35 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  43.97 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  45.45 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  45.45 
 
 		 247 aa  154  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  40.09 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  43.06 
 
 		 268 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  35.12 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  36.36 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  35.83 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  37.95 
 
 		 193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  37.55 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  36.24 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  34.06 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  30.08 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  33.33 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  31.19 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  30.59 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  27.78 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  30.73 
 
 		 655 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  32.76 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  30.22 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  28.5 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  29.14 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  35.48 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  30.26 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  26.15 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  28.29 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  30.11 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  30.68 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  26.19 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  31.95 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  28.1 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  30.45 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  27.42 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  30.06 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  30.57 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  30.96 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  27.27 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  25.84 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  26.67 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  28.78 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  28.7 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2859  hypothetical protein  27.93 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  27.14 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  29.14 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  26.19 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  21.36 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  22.28 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  25.5 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>