58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2557 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  497  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  92.21 
 
 
244 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  74.79 
 
 
245 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  53.57 
 
 
237 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  46.12 
 
 
250 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  43.97 
 
 
249 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  43.97 
 
 
249 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  45.57 
 
 
261 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0437  hypothetical protein  43.48 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  43.72 
 
 
247 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  43.72 
 
 
247 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  43.53 
 
 
250 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  39.39 
 
 
251 aa  148  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  41.4 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  36.5 
 
 
220 aa  131  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  36 
 
 
226 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  38.2 
 
 
224 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  36.91 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  35.68 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  35.9 
 
 
193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  34.58 
 
 
238 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  31.2 
 
 
223 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  33.05 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  35.43 
 
 
224 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  30.74 
 
 
239 aa  92  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  31.53 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  30.39 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  32.18 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  30.56 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  31.58 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  37.1 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  29.44 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  27.06 
 
 
224 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  30.16 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  28.21 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  30.95 
 
 
655 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  28.24 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  28.72 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  32.54 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  28.49 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  27.66 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  26.78 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  30 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  29 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  30.35 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  29.38 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  27.53 
 
 
209 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  29.5 
 
 
208 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  29.59 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  28.32 
 
 
205 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  28.04 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  28.64 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2859  hypothetical protein  30.1 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  31.13 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  22.44 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  27.98 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  24.55 
 
 
204 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>