62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1961 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  66.82 
 
 
220 aa  299  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  66.18 
 
 
208 aa  295  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  51.01 
 
 
216 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  44.17 
 
 
214 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  41.91 
 
 
246 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  36.57 
 
 
224 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  32.26 
 
 
241 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  34.3 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  34.01 
 
 
256 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  38.32 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  37.57 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  37.5 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  31.29 
 
 
225 aa  94  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  37.04 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  37.65 
 
 
224 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  32.6 
 
 
211 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  29.73 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  32.47 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  30.13 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  35.96 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  33.58 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  32.12 
 
 
228 aa  85.5  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  31.45 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  36.78 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  33.78 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  31.29 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  32.16 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  31.76 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  32.37 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  33.11 
 
 
216 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  36.5 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0437  hypothetical protein  29.47 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  32.22 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  32.88 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  31.61 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  37.96 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2859  hypothetical protein  28.95 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  31.61 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  33.96 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  31.55 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  33.58 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  29.79 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0170  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  30.21 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  29.84 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  28.27 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  25.36 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  29 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  28.19 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  30.06 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  29.09 
 
 
261 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  29.19 
 
 
655 aa  62  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  26.78 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  26.78 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  26.78 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0458  hypothetical protein  26.4 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00393236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  23.65 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0179  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.13 
 
 
213 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196105  normal  0.76032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>