61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0399 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  66.52 
 
 		 224 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  66.07 
 
 		 224 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  61.61 
 
 		 224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  41.48 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  41.48 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  30.96 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  37.65 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  34.13 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  34.05 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  34.32 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  34.81 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  35.36 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  36.25 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  32.7 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  33.19 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  33.33 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  34.88 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  33.53 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  31.58 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  32.34 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  31.2 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  37.71 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  40 
 
 		 655 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  39.86 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  36.18 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  29.66 
 
 		 261 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  31.17 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  40.12 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  30.08 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  29.31 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  35.8 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  34.27 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  29.9 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  32.68 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  38.18 
 
 		 239 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  30.48 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  29.05 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  29.49 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  33.13 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  29.02 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  29.02 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  28.27 
 
 		 249 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  28.15 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  35.29 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  32.59 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  29.79 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  33.58 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  26.34 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  29.09 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0170  hypothetical protein  32.09 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  34.33 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  34.27 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  31.39 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  32.09 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  29.52 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0437  hypothetical protein  28.88 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2859  hypothetical protein  27.75 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0713  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.87 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>