61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0808 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  100 
 
 
216 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  52.08 
 
 
208 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  51.01 
 
 
213 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  54.71 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  46 
 
 
214 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  41.1 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  36.9 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  43.45 
 
 
222 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  37.71 
 
 
223 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  36.73 
 
 
259 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  36.42 
 
 
228 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  31.22 
 
 
258 aa  99.8  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  39.16 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  30.88 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  28.23 
 
 
212 aa  95.9  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  37.35 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  37.35 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  34.27 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  28.78 
 
 
241 aa  91.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  31.28 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  27.85 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  33.56 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  33.77 
 
 
207 aa  89  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  32.37 
 
 
200 aa  89  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  29.86 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  36.09 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  30.43 
 
 
205 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  29.11 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  32.16 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  27.4 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  36.43 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  30.18 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  30.5 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  29.31 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  30.68 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2859  hypothetical protein  29.78 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0437  hypothetical protein  32.76 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  29.2 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  29.95 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0170  hypothetical protein  35.92 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  35.29 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  30.59 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  32.24 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  32.24 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  27.05 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  30.35 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  30.57 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  27.98 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  33.56 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  32.89 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  28.19 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  30.23 
 
 
245 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  32.03 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  31.58 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  29.94 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  31.58 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  29.87 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  30.07 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  28.12 
 
 
655 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  30.29 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0458  hypothetical protein  24.48 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00393236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>