59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3197 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  100 
 
 
249 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  99.6 
 
 
249 aa  500  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  89.6 
 
 
250 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  65.32 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  43.97 
 
 
244 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  43.97 
 
 
244 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  43.78 
 
 
245 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  41.55 
 
 
237 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  40.98 
 
 
250 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  36.32 
 
 
226 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  37.68 
 
 
220 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  39.73 
 
 
251 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0437  hypothetical protein  35.84 
 
 
247 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  34.53 
 
 
247 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  34.53 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  35.94 
 
 
268 aa  118  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  34.45 
 
 
228 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  34.33 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  31.93 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  31.01 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  31.47 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  30.6 
 
 
224 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  28.27 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  28.84 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  34.22 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  28.32 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  28.27 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  30.41 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  30.35 
 
 
655 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  30.59 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  29.44 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  30.17 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  28.33 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  25.47 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  27.66 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  31.85 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  26.87 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  29.31 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  24 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  25.9 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  26.78 
 
 
213 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  31.58 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  27.08 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  27.17 
 
 
207 aa  56.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  23.46 
 
 
216 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  24.86 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  25.71 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  24.86 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  24 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  26.34 
 
 
208 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  26.7 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  25.83 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  25.79 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0170  hypothetical protein  24.62 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  22.02 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  20.9 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  20.9 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  20.9 
 
 
207 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  23.94 
 
 
205 aa  42  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>