60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0647 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  99.48 
 
 		 193 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  41.48 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  41.4 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  36.57 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  40 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  36.41 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  36.36 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  33.33 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  35.36 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  34.93 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  33.79 
 
 		 212 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  36.68 
 
 		 256 aa  111  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2557  hypothetical protein  35.68 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  34.47 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  32.34 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  34.27 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  37.91 
 
 		 242 aa  105  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  33.16 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  33.16 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  33.48 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  34.01 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  34.25 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  36.81 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  34.93 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  37.4 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  34.45 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  32.04 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  30.59 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  36.42 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  30.93 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  36.63 
 
 		 655 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  34.9 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  35.09 
 
 		 214 aa  96.3  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  34.97 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  33.9 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  32.99 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  30.63 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  30.49 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  34.22 
 
 		 239 aa  88.2  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  32.68 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  32.12 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  31.48 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  29.48 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  35.43 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  30.88 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  28.9 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  32.76 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2859  hypothetical protein  31.53 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  29.92 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0437  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  31.76 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  31.38 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  32.16 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0170  hypothetical protein  31.11 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  30.43 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  29.27 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3045  hypothetical protein  31.44 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>