57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0464 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0464  protein of unknown function DUF374  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.976613  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0527  hypothetical protein  58.25 
 
 		 204 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0170  hypothetical protein  56.22 
 
 		 203 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0646  protein of unknown function DUF374  56.06 
 
 		 203 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104263  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0486  protein of unknown function DUF374  50.5 
 
 		 215 aa  210  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1654  hypothetical protein  55.95 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0531  protein of unknown function DUF374  49.49 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0505  lipoprotein  31.68 
 
 		 212 aa  98.6  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0327  conserved hypothetical protein (DUF374 domain protein)  33.57 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0430  protein of unknown function DUF374  32.73 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0130  protein of unknown function DUF374  30.93 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000163832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2145  hypothetical protein  31.01 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4514  hypothetical protein  29.63 
 
 		 246 aa  94.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1640  protein of unknown function DUF374  29.32 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.762508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4539  hypothetical protein  31.79 
 
 		 238 aa  91.7  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1745  hypothetical protein  31.95 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0259  lipoprotein  29.21 
 
 		 258 aa  89  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3122  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  31.9 
 
 		 655 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1376  lipoprotein  28.67 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0596  GTP-binding protein  29.41 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.859758  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0426  hypothetical protein  30.94 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0482  hypothetical protein  27.14 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0433  hypothetical protein  30.94 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0507  hypothetical protein  27.14 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0399  hypothetical protein  32.09 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1482  hypothetical protein  26.87 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1961  hypothetical protein  31.55 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.232055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1061  protein of unknown function DUF374  30.04 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2971  hypothetical protein  28.65 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3978  protein of unknown function DUF374  31.03 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0366  protein of unknown function DUF374  34.03 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0287549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1415  hypothetical protein  32.61 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00106447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0065  protein of unknown function DUF374  32.59 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0779257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0647  protein of unknown function DUF374  28.57 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.483931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0808  protein of unknown function DUF374  29.59 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.887209  normal  0.845071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0560  hypothetical protein  27.14 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0487  hypothetical protein  30.43 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1621  protein of unknown function DUF374  28.9 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18950  hypothetical protein  30.81 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0652  hypothetical protein  30.94 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.120133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0190  hypothetical protein  30.37 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0642  hypothetical protein  29.63 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0634  hypothetical protein  30.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0680755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1638  hypothetical protein  30.25 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.717652  normal  0.0394631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0626  hypothetical protein  27.89 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3002  hypothetical protein  28.79 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.349241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0890  hypothetical protein  24.34 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0458  hypothetical protein  24.31 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00393236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3153  protein of unknown function DUF374  25.29 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1690  hypothetical protein  26.42 
 
 		 245 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0927844  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1205  hypothetical protein  25.71 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.927826  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1483  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3179  hypothetical protein  25.5 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0214  hypothetical protein  24.31 
 
 		 247 aa  42  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0194  hypothetical protein  24.31 
 
 		 247 aa  41.6  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3197  protein of unknown function DUF374  23.13 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2971  hypothetical protein  23.13 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>