89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1753 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1753  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 		 337 aa  685    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000160069  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1483  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  89.05 
 
 		 338 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0321246  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0003  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  62.68 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0604159  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0004  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  63.74 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.59 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  29.26 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06721  cell wall hydrolase/autolysin  32.91 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.347132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  33.52 
 
 		 538 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  30.95 
 
 		 703 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  30.28 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.49 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.94 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06421  cell wall hydrolase/autolysin  32.91 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2446  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.29 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2195  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.71 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2277  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.29 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.29 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2237  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.29 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0334199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.52 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3983  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.34 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529665  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  31.25 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0616  cell wall hydrolase/autolysin  30.38 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.81 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2134  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.373316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.95 
 
 		 529 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  27.72 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  34.65 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.4 
 
 		 529 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.98 
 
 		 529 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  33.05 
 
 		 535 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  33.05 
 
 		 535 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1702  cell wall hydrolase/autolysin  37.38 
 
 		 223 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  31.65 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.41 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.65 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.65 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.65 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.41 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06741  cell wall hydrolase/autolysin  32.1 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.09 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.56 
 
 		 619 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1724  cell wall hydrolase/autolysin  27.16 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0475505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  29.41 
 
 		 948 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.09 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.09 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.09 
 
 		 414 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.09 
 
 		 414 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.2 
 
 		 540 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 		 190 aa  49.7  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0053  cell wall hydrolase/autolysin  31.48 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2818  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00466291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.61 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  29.11 
 
 		 627 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.92 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.779123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  27.07 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.58 
 
 		 706 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  28.48 
 
 		 876 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.72 
 
 		 631 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.99 
 
 		 619 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.56 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0223149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  26.25 
 
 		 627 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18931  cell wall hydrolase/autolysin  26.75 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.29 
 
 		 410 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2870  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00570311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 543 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2849  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.99 
 
 		 244 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000907792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  32.63 
 
 		 250 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000101461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2834  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.99 
 
 		 244 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.49 
 
 		 657 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.29 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.45 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.35 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.29 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.29 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  31.25 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.68 
 
 		 242 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0265  cell wall hydrolase/autolysin  24.71 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.5 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  27.56 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1064  cell wall hydrolase/autolysin  31.58 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  27.34 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.14 
 
 		 657 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1869  cell wall hydrolase/autolysin  28.07 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000539921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0180  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.34 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  29.82 
 
 		 410 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.03 
 
 		 471 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.2 
 
 		 616 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.68 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0435442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  23.36 
 
 		 530 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>