75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_A0003 on replicon NC_008263
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008263  CPR_A0003  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  100 
 
 		 343 aa  700    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0604159  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0004  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  87.46 
 
 		 342 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1753  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  62.68 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000160069  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1483  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  62.39 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0321246  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06721  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.347132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.78 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06421  cell wall hydrolase/autolysin  32.43 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.78 
 
 		 706 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0616  cell wall hydrolase/autolysin  31.15 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  29.61 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.8 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.17 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0053  cell wall hydrolase/autolysin  30.85 
 
 		 361 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06741  cell wall hydrolase/autolysin  31.84 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  31.46 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.28 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  32.28 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.28 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.28 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.28 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  33.83 
 
 		 538 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  32.14 
 
 		 703 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  28.99 
 
 		 535 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.42 
 
 		 529 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.42 
 
 		 529 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.42 
 
 		 529 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  28.99 
 
 		 535 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.8 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.89 
 
 		 529 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  29.1 
 
 		 236 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.51 
 
 		 529 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.6 
 
 		 619 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.21 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.779123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  26.37 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0180  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.54 
 
 		 228 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 		 190 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.44 
 
 		 623 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.51 
 
 		 529 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  26.4 
 
 		 362 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.99 
 
 		 860 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0566  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.46 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.114273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.87 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  30.77 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  28.03 
 
 		 413 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.48 
 
 		 631 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.32 
 
 		 619 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2818  cell wall hydrolase/autolysin  28.31 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00466291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35 
 
 		 543 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  24.58 
 
 		 627 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18931  cell wall hydrolase/autolysin  25.7 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2134  cell wall hydrolase/autolysin  27.03 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.373316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.58 
 
 		 232 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000016019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2077  cell wall hydrolase/autolysin  26.06 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1724  cell wall hydrolase/autolysin  29.49 
 
 		 257 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0475505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2195  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 		 245 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2446  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  25.95 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2277  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1869  cell wall hydrolase/autolysin  26.57 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000539921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2237  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.95 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0334199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3088  sporulation-specific N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.3 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  hitchhiker  9.85648e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  25.14 
 
 		 627 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2295  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  27.08 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000158579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  27.22 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  28.26 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.47 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2236  sporulation-specific N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.3 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  24.47 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.19 
 
 		 242 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.46 
 
 		 553 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3983  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.77 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1350  cell wall hydrolase/autolysin  31.34 
 
 		 529 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000116689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.48 
 
 		 244 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>