120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06750 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06750  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 639 aa  1315    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  36.5 
 
 		 499 aa  95.1  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  32.82 
 
 		 306 aa  73.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  30.43 
 
 		 290 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  34.68 
 
 		 300 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  31.25 
 
 		 314 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  33.58 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  28.47 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04190  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 538 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  32.82 
 
 		 318 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  29.55 
 
 		 307 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  33.83 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  27.67 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  26.39 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  27.54 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  33.83 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  30.83 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  28 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  29.51 
 
 		 307 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  28.7 
 
 		 321 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  31.33 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  35.37 
 
 		 327 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  28.47 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  29.84 
 
 		 299 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  30.15 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  29.03 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  29.41 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  29.84 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  26.43 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  29.91 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06909  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997625  normal  0.453793 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  26.52 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  29.06 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  25.93 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  28.21 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  29.63 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  24.11 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  31.11 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  33.09 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  24.77 
 
 		 308 aa  57  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  26.72 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  27.78 
 
 		 298 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  28.45 
 
 		 306 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  33.77 
 
 		 306 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  27.35 
 
 		 315 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  30.37 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  30.37 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  28.15 
 
 		 325 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  30.37 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  30.37 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  30.37 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  30.37 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  32.5 
 
 		 306 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  25.86 
 
 		 304 aa  54.7  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  26.96 
 
 		 305 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  23.48 
 
 		 308 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  30.37 
 
 		 302 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  26.5 
 
 		 318 aa  53.9  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46366  predicted protein  29.07 
 
 		 519 aa  53.9  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0951479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  25.71 
 
 		 304 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  25.71 
 
 		 304 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  25.71 
 
 		 304 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  25.71 
 
 		 304 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  25.71 
 
 		 304 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  25.71 
 
 		 321 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  25.38 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29867  predicted protein  29.35 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.953466  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  36.11 
 
 		 308 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  25.71 
 
 		 321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  25.71 
 
 		 321 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  24.66 
 
 		 303 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  26.12 
 
 		 303 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  22.73 
 
 		 303 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30233  predicted protein  21.09 
 
 		 949 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.204381  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  30.12 
 
 		 296 aa  51.2  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46365  predicted protein  27.91 
 
 		 419 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  22.55 
 
 		 323 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  21.88 
 
 		 300 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  34.38 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  22.68 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  24.72 
 
 		 295 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  21.71 
 
 		 307 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 315 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46385  predicted protein  31.25 
 
 		 476 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  24.72 
 
 		 297 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  22.22 
 
 		 314 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  26.92 
 
 		 303 aa  48.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  22.22 
 
 		 314 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  32.46 
 
 		 306 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  32.46 
 
 		 306 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  20.69 
 
 		 306 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  27.52 
 
 		 308 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  24.48 
 
 		 300 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  21.65 
 
 		 305 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  33.64 
 
 		 303 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46336  predicted protein  27.2 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>