More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1326 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0537  C4-dicarboxylate transport protein  99.31 
 
 		 432 aa  855    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1326  C4-dicarboxylate transport protein  100 
 
 		 432 aa  860    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.18035  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1207  C4-dicarboxylate transport protein  98.84 
 
 		 458 aa  849    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1035  C4-dicarboxylate transport protein  59.4 
 
 		 444 aa  524  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00027628  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1512  glycosyl transferase, group 1  60.19 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0426  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  61.5 
 
 		 437 aa  511  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0556  sodium:dicarboxylate symporter  59.21 
 
 		 442 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.490902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0555  sodium:dicarboxylate symporter  59.35 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.98937  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0427  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  61.27 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.184739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  44.79 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.69 
 
 		 428 aa  358  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  45.45 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  45.22 
 
 		 428 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  45.22 
 
 		 428 aa  355  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.29 
 
 		 448 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.08 
 
 		 452 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.17 
 
 		 428 aa  352  8e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.18 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.18 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.18 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.94 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  44.1 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  44.82 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.97 
 
 		 442 aa  342  9e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.71 
 
 		 430 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  41.55 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.46 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.45 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.22 
 
 		 430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.93 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  42.65 
 
 		 437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  44.81 
 
 		 462 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.69 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.47 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  43.88 
 
 		 454 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.87 
 
 		 447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  42.92 
 
 		 457 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  41.45 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  43.97 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.32 
 
 		 444 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.12 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  43.97 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  41.22 
 
 		 450 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  42.92 
 
 		 453 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.59 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  41.51 
 
 		 449 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.6 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  41.19 
 
 		 447 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.41 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.57 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.12 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  40.71 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  41.19 
 
 		 447 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.55 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.49 
 
 		 443 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  40.28 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  40.52 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.31 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  41.71 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.48 
 
 		 440 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  42.96 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3533  sodium:dicarboxylate symporter  43.4 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.982128  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.96 
 
 		 420 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.23 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  42.45 
 
 		 460 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.67 
 
 		 429 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.72 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.72 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.72 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.6 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.72 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.72 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.23 
 
 		 430 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.23 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.23 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.75 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  41 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  41 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  41 
 
 		 444 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.44 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  39.63 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  39.63 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.27 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.43 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.43 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.97 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  40.24 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.59 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.15 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.76 
 
 		 428 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.16 
 
 		 452 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>