More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1512 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1035  C4-dicarboxylate transport protein  79.04 
 
 		 444 aa  691    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00027628  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1512  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 451 aa  901    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00486794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0426  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  71.36 
 
 		 437 aa  619  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0427  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  68.9 
 
 		 437 aa  599  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.184739  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0556  sodium:dicarboxylate symporter  63.43 
 
 		 442 aa  536  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.490902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0555  sodium:dicarboxylate symporter  62.44 
 
 		 440 aa  533  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.98937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1326  C4-dicarboxylate transport protein  59.13 
 
 		 432 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.18035  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0537  C4-dicarboxylate transport protein  59.13 
 
 		 432 aa  528  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1207  C4-dicarboxylate transport protein  57.89 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  42.73 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  42.43 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  42.79 
 
 		 442 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.67 
 
 		 448 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  43.09 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  44.5 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.9 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  40.72 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  40.72 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  41.53 
 
 		 454 aa  328  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.36 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  41.34 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  41.24 
 
 		 437 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.07 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  41.14 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.14 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.14 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.14 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.14 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.14 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  40.91 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.09 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.07 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  40.91 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  41.84 
 
 		 468 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.59 
 
 		 442 aa  323  5e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.49 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.2 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.82 
 
 		 452 aa  322  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.6 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  43.56 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  41.47 
 
 		 444 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  41.57 
 
 		 462 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  40.32 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  41.72 
 
 		 447 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.04 
 
 		 428 aa  319  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.22 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3533  sodium:dicarboxylate symporter  41.94 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.982128  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  40.09 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  40.09 
 
 		 440 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  42.39 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.99 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.4 
 
 		 447 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  42.39 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  40.77 
 
 		 434 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4523  sodium:dicarboxylate symporter  43.22 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.33 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.92 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.76 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.76 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.53 
 
 		 430 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  40.33 
 
 		 449 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3060  sodium:dicarboxylate symporter  41.14 
 
 		 449 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.86 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  40.19 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 447 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.39 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.39 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.53 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.53 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.74 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.74 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.74 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.95 
 
 		 454 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  39.72 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.15 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.12 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.15 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.15 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.15 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  42.19 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2297  sodium:dicarboxylate symporter  41.63 
 
 		 450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.372192  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0995  C4-dicarboxylate transport transmembrane protein  39.05 
 
 		 447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.37068  normal  0.0301599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.16 
 
 		 449 aa  309  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.11 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.4 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.63 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  40.23 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  41.26 
 
 		 446 aa  306  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.09 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.55 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2923  sodium:dicarboxylate symporter  42.34 
 
 		 442 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.09 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  38.64 
 
 		 449 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.47 
 
 		 413 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.75 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.59 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  41.16 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0518  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.47 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51947  normal  0.633866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.14 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>