More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0555 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0556  sodium:dicarboxylate symporter  85.84 
 
 		 442 aa  735    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.490902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0555  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 440 aa  864    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.98937  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1035  C4-dicarboxylate transport protein  63.53 
 
 		 444 aa  552  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00027628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0426  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  66.51 
 
 		 437 aa  549  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0427  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  63.74 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.184739  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1512  glycosyl transferase, group 1  64.39 
 
 		 451 aa  524  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0537  C4-dicarboxylate transport protein  59.58 
 
 		 432 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1207  C4-dicarboxylate transport protein  59.23 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1326  C4-dicarboxylate transport protein  59.35 
 
 		 432 aa  510  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.18035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.2 
 
 		 452 aa  362  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.49 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  45.01 
 
 		 437 aa  352  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.57 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.84 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  44.26 
 
 		 439 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  44.66 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.74 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.82 
 
 		 429 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.42 
 
 		 451 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.89 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.78 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.13 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  44.9 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.79 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  43.22 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  43.54 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  43.3 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  43.3 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.36 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1440  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.96 
 
 		 448 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.022063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.65 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.21 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3533  sodium:dicarboxylate symporter  43.81 
 
 		 423 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.982128  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  42.55 
 
 		 447 aa  331  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.33 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.94 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.8 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  41.9 
 
 		 440 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  43.55 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  41.9 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.19 
 
 		 452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.47 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  42.34 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  41.22 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  41.43 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  41.85 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  41.3 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  42.23 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.46 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.46 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  40.76 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  41.99 
 
 		 447 aa  326  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.34 
 
 		 436 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  42.18 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.55 
 
 		 444 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.23 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.46 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  41.99 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.46 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.09 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.46 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.2 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.23 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.54 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  42.42 
 
 		 462 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.63 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  40.66 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.07 
 
 		 440 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  40.43 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.51 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.72 
 
 		 454 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.07 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  41.23 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.52 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  42.89 
 
 		 414 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.45 
 
 		 430 aa  319  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.19 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.34 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.31 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.48 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.48 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.48 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.13 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  43.55 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.13 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.13 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.84 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.23 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.23 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.23 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>