More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0427 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0426  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  91.72 
 
 		 437 aa  786    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0427  aerobic C4-dicarboxylate transport protein  100 
 
 		 437 aa  870    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.184739  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1512  glycosyl transferase, group 1  68.9 
 
 		 451 aa  593  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1035  C4-dicarboxylate transport protein  68.78 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00027628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0556  sodium:dicarboxylate symporter  64.29 
 
 		 442 aa  558  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.490902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0555  sodium:dicarboxylate symporter  63.74 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.98937  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1207  C4-dicarboxylate transport protein  59.69 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1326  C4-dicarboxylate transport protein  61.27 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.18035  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0537  C4-dicarboxylate transport protein  61.27 
 
 		 432 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  45.43 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  44.71 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3547  sodium:dicarboxylate symporter  42.18 
 
 		 454 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.17 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  43.86 
 
 		 437 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.93 
 
 		 448 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.53 
 
 		 465 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.76 
 
 		 451 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.72 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  44.77 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4523  sodium:dicarboxylate symporter  47.34 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.281817  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.58 
 
 		 442 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.27 
 
 		 429 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  42.49 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  42.29 
 
 		 460 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.49 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.49 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.49 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.49 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.49 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.27 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.49 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  42.25 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  42.25 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4299  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.42 
 
 		 452 aa  319  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.65 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  42 
 
 		 450 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  42.68 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  42.68 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  44.07 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.28 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  41.77 
 
 		 450 aa  317  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.86 
 
 		 428 aa  316  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.76 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 434 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.3 
 
 		 413 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.2 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.72 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2129  sodium:dicarboxylate symporter  41.32 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213541  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.2 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.65 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  42.2 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0309  sodium:dicarboxylate symporter  42.27 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  40.24 
 
 		 440 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  42.09 
 
 		 449 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  43.17 
 
 		 455 aa  312  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  41.85 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.86 
 
 		 420 aa  312  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.39 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.13 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.86 
 
 		 420 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.65 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 440 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4413  sodium:dicarboxylate symporter  41.71 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.62 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3380  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.62 
 
 		 420 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.41 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.38 
 
 		 420 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  41.59 
 
 		 449 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.09 
 
 		 440 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.93 
 
 		 429 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  39.63 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.42 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.51 
 
 		 430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.36 
 
 		 440 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  41.89 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.07 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.47 
 
 		 429 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.47 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.44 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.47 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.44 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.44 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.63 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0995  C4-dicarboxylate transport transmembrane protein  40.81 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.37068  normal  0.0301599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.68 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.68 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.2 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.12 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8666  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 		 466 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  42.23 
 
 		 429 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3060  sodium:dicarboxylate symporter  39.86 
 
 		 449 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694529  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.19 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.19 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.19 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.19 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.19 
 
 		 428 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  41.32 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  41.5 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  41.32 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>