More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0551 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0551  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1569  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.83 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000273602  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.03 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.562052  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1094  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.44 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162529  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1219  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.03 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.751908  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0958  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.764783  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.17 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.48 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.62 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.06 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.55 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.06 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.02 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.06 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.02 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.5 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.67 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  37.56 
 
 		 289 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.8 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.92 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.54 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.35 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0344  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.35 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  29 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.72 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.38 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.89 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.85 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  27 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.86 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  35.91 
 
 		 313 aa  96.7  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.82 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.92 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.18 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.66 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.84 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.91 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.32 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  29.69 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.81 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.3 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.9 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.35 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.27 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.37 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.98 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.62 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.87 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.57 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.31 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.31 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.32 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.19 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.48 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.28 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.69 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0188  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.38 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.84 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.1 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.24 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.82 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.84 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.45 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.24 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  36 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.23 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.5 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  31.35 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.29 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>