More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1723 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
248 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.02 
 
 
252 aa  191  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1569  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.52 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000273602  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0551  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
261 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.32 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.97 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0958  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.89 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.764783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.32 
 
 
270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.8 
 
 
260 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.08 
 
 
243 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.562052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.46 
 
 
260 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
273 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.87 
 
 
264 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1219  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.751908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.48 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1094  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162529  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.84 
 
 
263 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
270 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.69 
 
 
275 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.75 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
270 aa  115  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.68 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.54 
 
 
280 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
272 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
270 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
270 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.5 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
270 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.85 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.63 
 
 
277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.48 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.2 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
276 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
272 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.46 
 
 
278 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.37 
 
 
275 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  32.32 
 
 
289 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
264 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
267 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.87 
 
 
264 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.85 
 
 
270 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.45 
 
 
267 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 
272 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
272 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
272 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  33.5 
 
 
313 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
267 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.68 
 
 
270 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.46 
 
 
270 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
272 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.49 
 
 
279 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
272 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
272 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.1 
 
 
280 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
272 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
270 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.57 
 
 
267 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.34 
 
 
271 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.94 
 
 
255 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
270 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.19 
 
 
260 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
265 aa  105  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.68 
 
 
281 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
270 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.01 
 
 
271 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.27 
 
 
271 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.55 
 
 
255 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.32 
 
 
270 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.56 
 
 
274 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 
277 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
267 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.56 
 
 
256 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
263 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.19 
 
 
274 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
314 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
281 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.92 
 
 
279 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>