More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1219 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1219  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.751908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1094  pyrroline-5-carboxylate reductase  99.59 
 
 
243 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162529  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  96.71 
 
 
243 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.562052  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0958  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.14 
 
 
231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.764783  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0551  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.03 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1569  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.71 
 
 
248 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000273602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.44 
 
 
252 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.54 
 
 
275 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.16 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.86 
 
 
260 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.12 
 
 
270 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.16 
 
 
266 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.25 
 
 
260 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.32 
 
 
280 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.7 
 
 
282 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.4 
 
 
264 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
270 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
247 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.84 
 
 
266 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.59 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7890  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.35 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  31.12 
 
 
289 aa  98.2  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.23 
 
 
301 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.17 
 
 
276 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.5 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.68 
 
 
269 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.1 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.37 
 
 
266 aa  95.9  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.29 
 
 
270 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.46 
 
 
263 aa  95.5  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
263 aa  95.5  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.92 
 
 
276 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.93 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.5 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.85 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.64 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.64 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  27.31 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.69 
 
 
256 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.92 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.93 
 
 
272 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.63 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.38 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.35 
 
 
265 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
256 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.41 
 
 
268 aa  92.8  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.44 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.84 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
268 aa  92.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.23 
 
 
264 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.22 
 
 
276 aa  92  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.3 
 
 
279 aa  92  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.51 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.5 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.69 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.68 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.04 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2466  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.7 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.35 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.94 
 
 
273 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.42 
 
 
277 aa  89  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.12 
 
 
276 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.7 
 
 
274 aa  88.6  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  88.6  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  26 
 
 
274 aa  88.2  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  29.94 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.59 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.35 
 
 
277 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.34 
 
 
269 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.94 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.03 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.37 
 
 
278 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0357  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.53 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  31.67 
 
 
313 aa  86.3  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.69 
 
 
276 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.32 
 
 
272 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0842  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.9 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.4 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.52 
 
 
280 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
274 aa  85.1  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.34 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.9 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.43 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.43 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.53 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>