More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0958 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0958  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.764783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.26 
 
 
243 aa  278  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.562052  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1219  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.14 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.751908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1094  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.14 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0551  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.73 
 
 
261 aa  205  5e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.120124  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1569  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.61 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000273602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.1 
 
 
252 aa  153  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.89 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.5 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
260 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.17 
 
 
247 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
265 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.2 
 
 
266 aa  100  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.09 
 
 
269 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.96 
 
 
270 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0344  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.86 
 
 
257 aa  95.5  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
282 aa  95.1  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.46 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.69 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.27 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.95 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.96 
 
 
271 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.74 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.5 
 
 
275 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.68 
 
 
270 aa  92  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  30.56 
 
 
313 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.31 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  31.63 
 
 
289 aa  89.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.51 
 
 
271 aa  89.4  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.36 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.36 
 
 
272 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.26 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.59 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.02 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.85 
 
 
273 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
262 aa  86.3  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.41 
 
 
277 aa  86.3  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.59 
 
 
314 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.76 
 
 
274 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.12 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.23 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.8 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.76 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.43 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.36 
 
 
271 aa  82  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.79 
 
 
276 aa  81.6  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.14 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.86 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.59 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.66 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.17 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.86 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.41 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.1 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.23 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.29 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  27.32 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.33 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.71 
 
 
276 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.92 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.22 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.87 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.6 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.87 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.38 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.51 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.74 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.77 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.86 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.51 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  27 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
276 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.87 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.72 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.3 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2120  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.95 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.76 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>