More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3006 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3006  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6981  two component transcriptional regulator, winged helix family  94.76 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0378  two component transcriptional regulator  65.31 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3580  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.29 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0214492  hitchhiker  0.00000165063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2778  two component transcriptional regulator  66.97 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3585  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0667387  hitchhiker  0.00000255607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0373  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2783  two component transcriptional regulator  49.17 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  51.98 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1252  DNA-binding response regulator OmpR  52.1 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1094  DNA-binding response regulator  52.1 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1099  DNA-binding response regulator  52.1 
 
 		 241 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  51.26 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2405  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343281  normal  0.0119317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1789  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2160  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71041  hitchhiker  0.000000282055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 280 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0889  two component transcriptional regulator  51.68 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147318 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4297  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4185  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3387  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1125  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0750  DNA-binding response regulator OmpR  51.68 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1574  DNA-binding response regulator OmpR  51.68 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3023  DNA-binding response regulator OmpR  51.68 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0975164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0993  DNA-binding response regulator OmpR  51.68 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  44.87 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0515  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000767404  normal  0.580599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  45.92 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0573  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 243 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.437899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  44.44 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  44.83 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  44.44 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  44.21 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  45.02 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  44.21 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  44.21 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  44.02 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  44.21 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  44.64 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5962  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5598  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  44.02 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  44.16 
 
 		 239 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  43.78 
 
 		 239 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1839  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.1183  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  43.59 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  43.35 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4966  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  43.72 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6462  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.747199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  42.49 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  43.64 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14041  two-component response regulator  46.15 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  41.95 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3494  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  45.69 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  45.97 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0328  DNA-binding response regulator OmpR  44.4 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0258  osmolarity response regulator  44.4 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1898  osmolarity response regulator  45.97 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  0.515659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0260  osmolarity response regulator  43.53 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948807  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1569  osmolarity response regulator  45.97 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306137  normal  0.101265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1648  osmolarity response regulator  45.97 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  45.5 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0654  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  41.88 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  41.63 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>