More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4650 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 594 aa  1215    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  54.45 
 
 		 599 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  56.49 
 
 		 593 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  59.36 
 
 		 594 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  55.82 
 
 		 600 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  61.21 
 
 		 592 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  55.89 
 
 		 594 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  51.47 
 
 		 624 aa  617  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  52.22 
 
 		 609 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  53.77 
 
 		 607 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  54.33 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  52.84 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  52.44 
 
 		 616 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  53.06 
 
 		 597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  48.78 
 
 		 613 aa  562  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  51.07 
 
 		 601 aa  561  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  51.14 
 
 		 612 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  47.94 
 
 		 615 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  47.33 
 
 		 601 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  35.3 
 
 		 570 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  34.78 
 
 		 545 aa  293  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  35.14 
 
 		 570 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  35.47 
 
 		 570 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  35.47 
 
 		 570 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  35.29 
 
 		 570 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  34.89 
 
 		 570 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  34.89 
 
 		 570 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  34.89 
 
 		 570 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  35.08 
 
 		 573 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  34.46 
 
 		 568 aa  276  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  33.22 
 
 		 564 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  34.3 
 
 		 562 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  33.44 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.5 
 
 		 563 aa  267  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.57 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.21 
 
 		 590 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 		 643 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  31.05 
 
 		 642 aa  250  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  33.8 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  33.17 
 
 		 630 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  31.95 
 
 		 586 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  31.09 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.17 
 
 		 541 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  32.56 
 
 		 543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  30.03 
 
 		 601 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  30.53 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 		 529 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  29 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  32.37 
 
 		 538 aa  208  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  30.5 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.4 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  30.68 
 
 		 531 aa  203  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  33.59 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  27.79 
 
 		 586 aa  199  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  31.67 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  28.74 
 
 		 537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  27.89 
 
 		 592 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  30.64 
 
 		 535 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  30.52 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  29.8 
 
 		 553 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  27.2 
 
 		 581 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  29.87 
 
 		 536 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  29.48 
 
 		 534 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  28.57 
 
 		 534 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  27.83 
 
 		 530 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  30.18 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  30.53 
 
 		 539 aa  187  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  28.52 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  31.02 
 
 		 595 aa  185  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  27.7 
 
 		 525 aa  185  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.29 
 
 		 531 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  29.71 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  27.18 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  27.94 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  28.18 
 
 		 587 aa  180  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  29.46 
 
 		 533 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  29.61 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  30.59 
 
 		 612 aa  178  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  28.93 
 
 		 527 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  26.39 
 
 		 587 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  29.08 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  28.86 
 
 		 538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  27.46 
 
 		 556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  31.06 
 
 		 620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.26 
 
 		 587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1499  gamma-glutamyltransferase 2  30.57 
 
 		 525 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0519  gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 		 532 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  29.93 
 
 		 528 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  26.45 
 
 		 587 aa  173  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  30.24 
 
 		 525 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  29.19 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3091  gamma-glutamyltransferase 1  26.97 
 
 		 593 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000120341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  30.35 
 
 		 614 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.07 
 
 		 597 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  28.36 
 
 		 539 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0149  gamma-glutamyltransferase  30.65 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  28.5 
 
 		 558 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  25.25 
 
 		 604 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>