More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3004 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
612 aa  1182    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  61.69 
 
 
616 aa  643    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  58.35 
 
 
607 aa  618  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  53.5 
 
 
599 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  57.1 
 
 
593 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  51.46 
 
 
594 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  53.34 
 
 
600 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  50.9 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  55.46 
 
 
592 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  54.08 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  50.08 
 
 
593 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  49.51 
 
 
594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  53.83 
 
 
597 aa  545  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  50.16 
 
 
624 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  53.46 
 
 
601 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  50.56 
 
 
609 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  48.57 
 
 
613 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  52.27 
 
 
615 aa  528  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  54.74 
 
 
601 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  34.54 
 
 
573 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  34.52 
 
 
586 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  30.82 
 
 
642 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  34.22 
 
 
630 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  32.89 
 
 
593 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  30.66 
 
 
570 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  30.5 
 
 
570 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  31.44 
 
 
570 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 
568 aa  210  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  30.5 
 
 
570 aa  210  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  30.91 
 
 
545 aa  209  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  31.55 
 
 
570 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 
570 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  30.42 
 
 
564 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  31.28 
 
 
570 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  31.12 
 
 
570 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  29.89 
 
 
643 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  31.72 
 
 
601 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  30.52 
 
 
565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  30.53 
 
 
563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 
553 aa  197  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  32.5 
 
 
533 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  32.7 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  30.29 
 
 
579 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  29.85 
 
 
563 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  30.81 
 
 
533 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  30 
 
 
590 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.28 
 
 
536 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.97 
 
 
565 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  33.22 
 
 
539 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  29.77 
 
 
541 aa  179  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  32.97 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  30.18 
 
 
562 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  31.54 
 
 
512 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  27.29 
 
 
534 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  31.57 
 
 
536 aa  173  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  28.46 
 
 
581 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  27.96 
 
 
586 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  27.06 
 
 
561 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  26.74 
 
 
556 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  33.16 
 
 
595 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  26.56 
 
 
556 aa  170  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  31.45 
 
 
568 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2681  gamma-glutamyltransferase  31.57 
 
 
549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147051  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  28.33 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  33.02 
 
 
531 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  28.33 
 
 
592 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  32.51 
 
 
531 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  27.75 
 
 
587 aa  167  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  29.91 
 
 
534 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  32.57 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  30.92 
 
 
596 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.6 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  26.55 
 
 
580 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  26.38 
 
 
577 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  26.38 
 
 
581 aa  164  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  26.06 
 
 
581 aa  164  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  31.06 
 
 
557 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  31.06 
 
 
557 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  31.06 
 
 
557 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  27.32 
 
 
590 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  26.22 
 
 
580 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  26.22 
 
 
580 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  30.9 
 
 
634 aa  161  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  29.67 
 
 
534 aa  161  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  33.39 
 
 
538 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3136  gamma-glutamyltransferase  32.53 
 
 
614 aa  160  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  26.06 
 
 
580 aa  160  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  26.06 
 
 
580 aa  160  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 
557 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 
557 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  27.55 
 
 
583 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 
557 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 
557 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  29.42 
 
 
535 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  27.14 
 
 
579 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1349  gamma-glutamyltransferase 2  32.73 
 
 
528 aa  158  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  29.93 
 
 
526 aa  158  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3609  gamma-glutamyltransferase  29.97 
 
 
579 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  29.84 
 
 
529 aa  158  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  26.94 
 
 
587 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>