More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4106 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  55.37 
 
 		 599 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 594 aa  1218    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  55.89 
 
 		 594 aa  688    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  82.15 
 
 		 594 aa  1020    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  57.84 
 
 		 592 aa  679    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  57.07 
 
 		 600 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  90.74 
 
 		 593 aa  1114    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  55.25 
 
 		 607 aa  624  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  55.59 
 
 		 593 aa  618  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  53.34 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  49.1 
 
 		 624 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  51.32 
 
 		 601 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  49.84 
 
 		 609 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  52.32 
 
 		 597 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  51.16 
 
 		 615 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  49.02 
 
 		 613 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  49.35 
 
 		 616 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  49.1 
 
 		 612 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  49.67 
 
 		 601 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  34.01 
 
 		 573 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  35.48 
 
 		 642 aa  290  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  34.6 
 
 		 593 aa  289  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 		 630 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.09 
 
 		 545 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  32.92 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  32.92 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  32.92 
 
 		 570 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 		 570 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 		 570 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  31.98 
 
 		 570 aa  269  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 		 570 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  31.97 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 		 570 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.39 
 
 		 563 aa  267  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  32.28 
 
 		 643 aa  264  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.36 
 
 		 565 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  31.56 
 
 		 586 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  31.52 
 
 		 561 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  30.17 
 
 		 590 aa  242  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  30.45 
 
 		 601 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  31.58 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  31.74 
 
 		 553 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  32.07 
 
 		 565 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  31.62 
 
 		 543 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  30.53 
 
 		 534 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  29.57 
 
 		 586 aa  224  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  29.24 
 
 		 556 aa  217  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  30.26 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  28.83 
 
 		 581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  29.5 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  29.07 
 
 		 556 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.25 
 
 		 536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  28.99 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  30.2 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  29.82 
 
 		 533 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  30.05 
 
 		 534 aa  212  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  30.74 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  29.41 
 
 		 576 aa  210  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  30.41 
 
 		 526 aa  208  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.96 
 
 		 587 aa  207  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  29.09 
 
 		 583 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  29.09 
 
 		 583 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  30.78 
 
 		 531 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  29.09 
 
 		 583 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  30 
 
 		 539 aa  206  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 		 542 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  28.72 
 
 		 587 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  29.16 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  27.51 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  29.19 
 
 		 594 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  29.09 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  29.33 
 
 		 597 aa  204  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  27.79 
 
 		 587 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  28.64 
 
 		 587 aa  204  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  29.91 
 
 		 535 aa  204  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  27.35 
 
 		 604 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  29.68 
 
 		 568 aa  203  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  28.9 
 
 		 580 aa  203  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  32.15 
 
 		 540 aa  202  9e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  27.83 
 
 		 590 aa  203  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  29.93 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  29.88 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  29.4 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  27.13 
 
 		 599 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  30.28 
 
 		 576 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  29.76 
 
 		 587 aa  200  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  34.3 
 
 		 542 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  27.42 
 
 		 583 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.28 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  28.9 
 
 		 594 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  29.04 
 
 		 557 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  31.24 
 
 		 612 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  27.82 
 
 		 529 aa  197  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  29.17 
 
 		 525 aa  197  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  29.87 
 
 		 587 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  29.18 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>