More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  62.89 
 
 
607 aa  712    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  56.38 
 
 
594 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  70.76 
 
 
593 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  58.5 
 
 
597 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  100 
 
 
594 aa  1194    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  55.33 
 
 
599 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  56.64 
 
 
600 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  53.34 
 
 
594 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  56.69 
 
 
615 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  52.93 
 
 
593 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  56.88 
 
 
601 aa  598  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  53.27 
 
 
624 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  53.01 
 
 
594 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  53.02 
 
 
609 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  57.38 
 
 
601 aa  568  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  51.79 
 
 
613 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  53.56 
 
 
616 aa  557  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  53.65 
 
 
592 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  54.32 
 
 
612 aa  536  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  35.68 
 
 
586 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  31.89 
 
 
642 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 
573 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.01 
 
 
568 aa  223  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  30.74 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.74 
 
 
570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  30.09 
 
 
564 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  31.25 
 
 
570 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  31.25 
 
 
570 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.25 
 
 
570 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 
570 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  30.74 
 
 
570 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.09 
 
 
590 aa  220  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  32.32 
 
 
630 aa  219  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  30.91 
 
 
545 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  30.57 
 
 
570 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 
565 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  28.93 
 
 
643 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.26 
 
 
579 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  30.82 
 
 
563 aa  207  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  31.95 
 
 
593 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  30.48 
 
 
563 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  31.63 
 
 
562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  30.7 
 
 
553 aa  197  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  29.9 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  31.9 
 
 
533 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  30.07 
 
 
536 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  30.24 
 
 
534 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  31.18 
 
 
534 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.31 
 
 
586 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  30.02 
 
 
601 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  30.86 
 
 
533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  33.5 
 
 
538 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  30.55 
 
 
568 aa  174  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.94 
 
 
527 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  29.64 
 
 
533 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  29.83 
 
 
565 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  27.76 
 
 
587 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  27.07 
 
 
583 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.03 
 
 
512 aa  170  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  28.67 
 
 
534 aa  170  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  28.44 
 
 
576 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  27.9 
 
 
561 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  26.91 
 
 
583 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  31.12 
 
 
525 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  27.36 
 
 
581 aa  167  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  28.12 
 
 
583 aa  166  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.36 
 
 
587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  29.68 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.21 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  27.91 
 
 
529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  27.5 
 
 
645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  26.16 
 
 
583 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  26.62 
 
 
645 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  27.6 
 
 
590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  27.05 
 
 
592 aa  165  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  31.35 
 
 
542 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  29.73 
 
 
531 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  27.62 
 
 
530 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  30.38 
 
 
539 aa  161  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  28.13 
 
 
537 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  26.12 
 
 
583 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  26.12 
 
 
583 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  30.55 
 
 
543 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  26.8 
 
 
575 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  27.99 
 
 
580 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  26.8 
 
 
575 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  28.64 
 
 
529 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  25.97 
 
 
587 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  30.41 
 
 
525 aa  157  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  30.74 
 
 
531 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  27.4 
 
 
579 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  31.64 
 
 
542 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  27.13 
 
 
581 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  26.16 
 
 
583 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  26.58 
 
 
587 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  31.14 
 
 
529 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  26.58 
 
 
587 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  27.1 
 
 
575 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  30.15 
 
 
539 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  27.21 
 
 
592 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>