More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1305 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  60.25 
 
 		 630 aa  770    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  66.67 
 
 		 642 aa  879    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 643 aa  1339    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  33.83 
 
 		 594 aa  293  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 		 593 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  32.28 
 
 		 594 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  31.57 
 
 		 599 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  33 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.27 
 
 		 600 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  30.91 
 
 		 594 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  30.55 
 
 		 609 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.32 
 
 		 570 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 581 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  30.32 
 
 		 570 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  30.16 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  29.79 
 
 		 607 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  30.48 
 
 		 570 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  30.32 
 
 		 570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  30.85 
 
 		 616 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  30.32 
 
 		 570 aa  218  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  29.37 
 
 		 580 aa  217  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  30.16 
 
 		 570 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  30.65 
 
 		 545 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  30.48 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  28.48 
 
 		 624 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 		 593 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  27.72 
 
 		 590 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  28.77 
 
 		 594 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  30.34 
 
 		 593 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  29.16 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  29.34 
 
 		 590 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  30.87 
 
 		 586 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  29.19 
 
 		 563 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  29.11 
 
 		 613 aa  203  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  30.73 
 
 		 597 aa  203  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  29.67 
 
 		 592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  29.55 
 
 		 568 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  28.86 
 
 		 565 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  29.17 
 
 		 580 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  28.04 
 
 		 573 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  28.8 
 
 		 580 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  28.3 
 
 		 576 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  27.97 
 
 		 587 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  28.39 
 
 		 617 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  28.8 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  28.8 
 
 		 580 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  26.78 
 
 		 583 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  28.8 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  28.26 
 
 		 580 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  28.34 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  28.26 
 
 		 580 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  28.62 
 
 		 580 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  27.32 
 
 		 599 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  28.08 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  28.65 
 
 		 581 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  28.08 
 
 		 580 aa  190  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  28.08 
 
 		 580 aa  190  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  28.26 
 
 		 577 aa  190  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  27.56 
 
 		 601 aa  189  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  26.97 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  26.97 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.29 
 
 		 587 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  27.27 
 
 		 579 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  26.8 
 
 		 579 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  27.83 
 
 		 619 aa  187  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  26.8 
 
 		 579 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  26.46 
 
 		 579 aa  186  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  32.19 
 
 		 645 aa  187  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  27.56 
 
 		 594 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  26.64 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  32.04 
 
 		 645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  26.21 
 
 		 556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.94 
 
 		 587 aa  183  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  32.63 
 
 		 586 aa  183  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  26.21 
 
 		 556 aa  183  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  27.86 
 
 		 583 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  27.23 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  28.44 
 
 		 606 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  26.81 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  26.81 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  26.81 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  27.27 
 
 		 578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  25.81 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  27.13 
 
 		 582 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0021  gamma-glutamyltransferase  27.06 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0161  gamma-glutamyltranspeptidase  28.29 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  32.42 
 
 		 583 aa  177  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  27.76 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  29.14 
 
 		 612 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  26.98 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  35.73 
 
 		 541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  27.45 
 
 		 615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  28.04 
 
 		 577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  27.57 
 
 		 587 aa  173  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  26.98 
 
 		 597 aa  173  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  27.23 
 
 		 553 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  26.92 
 
 		 589 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  28.11 
 
 		 574 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 		 610 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3208  gamma-glutamyltransferase  27.45 
 
 		 577 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>