More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3042 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  59.68 
 
 
642 aa  802    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  59.47 
 
 
643 aa  774    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
630 aa  1288    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  36.7 
 
 
594 aa  291  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  36.54 
 
 
593 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  34.48 
 
 
594 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  33.96 
 
 
600 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  34.51 
 
 
562 aa  259  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  33.62 
 
 
599 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  33.92 
 
 
586 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  32.31 
 
 
624 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  33.17 
 
 
594 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  33 
 
 
609 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  32.95 
 
 
601 aa  226  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  32.42 
 
 
593 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  34.25 
 
 
607 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  33.1 
 
 
592 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  31.33 
 
 
573 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  29.1 
 
 
570 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  29.1 
 
 
570 aa  223  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  29.1 
 
 
545 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  29.1 
 
 
570 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  29.59 
 
 
563 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  32.59 
 
 
616 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 
579 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  29.3 
 
 
570 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  34.14 
 
 
597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  29.34 
 
 
570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  34.52 
 
 
593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 
564 aa  218  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  32.47 
 
 
594 aa  217  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  29.51 
 
 
570 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  32.63 
 
 
615 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  29.51 
 
 
570 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  32.44 
 
 
613 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  29.56 
 
 
565 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  29.17 
 
 
570 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  29.86 
 
 
590 aa  210  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  28.38 
 
 
563 aa  210  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 
541 aa  207  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  28.57 
 
 
568 aa  205  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  30 
 
 
580 aa  203  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  30.16 
 
 
576 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  29.12 
 
 
581 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  29.97 
 
 
601 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  26.99 
 
 
590 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  30.55 
 
 
553 aa  197  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  29.55 
 
 
565 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  28.77 
 
 
579 aa  193  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  30.07 
 
 
587 aa  191  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  29.22 
 
 
645 aa  189  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0722  gamma-glutamyltransferase  28.99 
 
 
594 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  26.14 
 
 
617 aa  188  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0082  gamma-glutamyltransferase  29.63 
 
 
594 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0026  gamma-glutamyltransferase  29.02 
 
 
577 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  29.26 
 
 
561 aa  187  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  28.46 
 
 
645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  27.35 
 
 
579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  33.2 
 
 
612 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  27.35 
 
 
579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  27.18 
 
 
579 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  27.46 
 
 
579 aa  184  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  26.57 
 
 
581 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  27.67 
 
 
599 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  32.45 
 
 
542 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  29.46 
 
 
586 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  27.94 
 
 
604 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  28.63 
 
 
579 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  28.63 
 
 
579 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  28.44 
 
 
579 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  28.44 
 
 
579 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  32.1 
 
 
601 aa  178  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  31.72 
 
 
543 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  27.79 
 
 
606 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  26.79 
 
 
576 aa  176  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  27.18 
 
 
556 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  29.73 
 
 
541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  27.78 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  27.5 
 
 
556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  27.82 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  27.17 
 
 
582 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  28.29 
 
 
599 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  27.52 
 
 
583 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4485  gamma-glutamyltransferase  30.23 
 
 
583 aa  173  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  27 
 
 
576 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  29.64 
 
 
583 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  29.15 
 
 
541 aa  170  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  29.24 
 
 
583 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  29.59 
 
 
512 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  29.62 
 
 
583 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  29.46 
 
 
583 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  29.62 
 
 
583 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  28.14 
 
 
579 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0191  gamma-glutamyltransferase  28.45 
 
 
581 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  27.95 
 
 
578 aa  167  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0138  gamma-glutamyltransferase  29.16 
 
 
570 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  29.62 
 
 
558 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  29.44 
 
 
583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  26.84 
 
 
566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  28.54 
 
 
589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>