More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3779 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  90.74 
 
 
594 aa  1114    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
593 aa  1211    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  56.49 
 
 
594 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  56.02 
 
 
599 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  81.48 
 
 
594 aa  1003    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  57.72 
 
 
600 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  57.5 
 
 
592 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  55.16 
 
 
607 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  52.93 
 
 
594 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  54.26 
 
 
593 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  49.67 
 
 
624 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  49.67 
 
 
609 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  51 
 
 
601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  52.25 
 
 
597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  48.45 
 
 
613 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  50.99 
 
 
615 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  49.35 
 
 
616 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  50.08 
 
 
612 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  50.76 
 
 
601 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  35.91 
 
 
642 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  34.76 
 
 
573 aa  287  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  36.54 
 
 
630 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  33.72 
 
 
593 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  34.3 
 
 
568 aa  280  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  34.72 
 
 
545 aa  279  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  34.66 
 
 
570 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  34.66 
 
 
570 aa  276  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  34.66 
 
 
570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  33.45 
 
 
570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  33.63 
 
 
570 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  33.45 
 
 
570 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  33.75 
 
 
570 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  33.27 
 
 
570 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  33.39 
 
 
643 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  32.68 
 
 
563 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.08 
 
 
564 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  33.09 
 
 
563 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.65 
 
 
565 aa  257  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  32.45 
 
 
586 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 
579 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  31.41 
 
 
561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  30.88 
 
 
601 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  32.65 
 
 
562 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
565 aa  237  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  30.6 
 
 
590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  32.71 
 
 
553 aa  233  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  30.87 
 
 
534 aa  223  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.18 
 
 
533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  29.6 
 
 
583 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  29.73 
 
 
583 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.98 
 
 
536 aa  220  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  31.33 
 
 
543 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.84 
 
 
541 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 
533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  30.95 
 
 
534 aa  214  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  29.62 
 
 
586 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  30.24 
 
 
526 aa  214  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  29.29 
 
 
556 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  29.38 
 
 
581 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  30.55 
 
 
534 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  29.29 
 
 
556 aa  209  8e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  29.02 
 
 
583 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  29.02 
 
 
583 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  28.67 
 
 
583 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  29.8 
 
 
576 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  29.02 
 
 
583 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  28.55 
 
 
590 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  30.63 
 
 
539 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  29.93 
 
 
525 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.74 
 
 
527 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  28.23 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  28.15 
 
 
592 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  28.07 
 
 
576 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.88 
 
 
587 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  30.99 
 
 
542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  28.5 
 
 
597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  32.2 
 
 
540 aa  200  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  28.35 
 
 
587 aa  200  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  30.99 
 
 
542 aa  200  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  29.9 
 
 
525 aa  200  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.09 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.16 
 
 
531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 
542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  27.71 
 
 
587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  28.98 
 
 
578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  28.79 
 
 
525 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  27.32 
 
 
604 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  30.94 
 
 
539 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  29.42 
 
 
535 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  30.26 
 
 
529 aa  197  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  27.49 
 
 
580 aa  197  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  28.3 
 
 
530 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  29.75 
 
 
545 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  30.45 
 
 
568 aa  196  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.53 
 
 
557 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  29.19 
 
 
541 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  27.7 
 
 
583 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  29.39 
 
 
545 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  27.49 
 
 
580 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  29.8 
 
 
533 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>