More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4046 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  85.39 
 
 		 609 aa  1053    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  52.8 
 
 		 599 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 		 624 aa  1272    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  54.35 
 
 		 600 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  68.58 
 
 		 613 aa  849    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  51.47 
 
 		 594 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  51.23 
 
 		 594 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  56.47 
 
 		 593 aa  605  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  54.43 
 
 		 607 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  49.1 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  49.67 
 
 		 593 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  53.27 
 
 		 594 aa  591  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  53.76 
 
 		 597 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  51.64 
 
 		 592 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  51.14 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  50.32 
 
 		 616 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  48.23 
 
 		 615 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  50.16 
 
 		 612 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  49.34 
 
 		 601 aa  477  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  32.52 
 
 		 570 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.57 
 
 		 564 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  32.98 
 
 		 570 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  32.81 
 
 		 570 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  32.81 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  33.61 
 
 		 586 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  32.81 
 
 		 570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  32.81 
 
 		 570 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  32.81 
 
 		 570 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.69 
 
 		 568 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  33.8 
 
 		 573 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  32.4 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  31.87 
 
 		 570 aa  242  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  32.31 
 
 		 630 aa  237  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  31 
 
 		 563 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  29.55 
 
 		 642 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  31.17 
 
 		 563 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  32.11 
 
 		 565 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  32.14 
 
 		 593 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  30.9 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  30.42 
 
 		 590 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  28.48 
 
 		 643 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  31.3 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.69 
 
 		 533 aa  210  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  29.42 
 
 		 529 aa  207  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  30.36 
 
 		 562 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  31.15 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.35 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  28.79 
 
 		 601 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  29.25 
 
 		 541 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  27.92 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  29.03 
 
 		 586 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  30.36 
 
 		 539 aa  187  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  29.75 
 
 		 536 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  26.82 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  28.24 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  28.32 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  30.88 
 
 		 546 aa  180  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  29.3 
 
 		 576 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  26.19 
 
 		 581 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  28.87 
 
 		 535 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  27.74 
 
 		 541 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  30.76 
 
 		 539 aa  177  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  28.05 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  30.53 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  30.67 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  28.57 
 
 		 587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  28.4 
 
 		 534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  27.04 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  26.53 
 
 		 534 aa  174  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  27.04 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  28.71 
 
 		 558 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  29.37 
 
 		 543 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  28.72 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  29.53 
 
 		 525 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  25.22 
 
 		 539 aa  170  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  29.48 
 
 		 538 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  31.33 
 
 		 588 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  31.35 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58626  gamma-glutamyltransferase  25.47 
 
 		 589 aa  167  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  29.46 
 
 		 540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  28.54 
 
 		 531 aa  166  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  29.31 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  26.64 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  29.31 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  29.31 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  31.83 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2396  gamma-glutamyltransferase  26.92 
 
 		 581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  29.31 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  26.61 
 
 		 587 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0011  Gamma-glutamyltransferase  28.54 
 
 		 531 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  29.81 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  26.24 
 
 		 576 aa  165  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  29.08 
 
 		 539 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  28.17 
 
 		 545 aa  164  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  26.16 
 
 		 579 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  30.53 
 
 		 546 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  29.14 
 
 		 557 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>