More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0574 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  100 
 
 
601 aa  1194    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  57.71 
 
 
593 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  53.8 
 
 
600 aa  595  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  52.4 
 
 
599 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  56.72 
 
 
594 aa  591  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  51.32 
 
 
594 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  52.16 
 
 
594 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  51 
 
 
593 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  53.31 
 
 
607 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  55.63 
 
 
592 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  54.93 
 
 
597 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  52.78 
 
 
615 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  51.07 
 
 
594 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  51.14 
 
 
624 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  52.74 
 
 
601 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  49.35 
 
 
609 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  48.05 
 
 
613 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  53.14 
 
 
612 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  51.3 
 
 
616 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  34.74 
 
 
586 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 
642 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  30.57 
 
 
564 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  31.43 
 
 
563 aa  227  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  32.95 
 
 
630 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  33.44 
 
 
573 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.63 
 
 
545 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.21 
 
 
565 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  31.37 
 
 
562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  30.6 
 
 
563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  31.8 
 
 
570 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  30.59 
 
 
568 aa  216  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  31.46 
 
 
570 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  31.63 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  31.29 
 
 
570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 
579 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.63 
 
 
570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  31.43 
 
 
590 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  30.79 
 
 
570 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.96 
 
 
570 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  31.13 
 
 
570 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  30.59 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.21 
 
 
527 aa  196  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.57 
 
 
586 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  30.48 
 
 
533 aa  190  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  31.03 
 
 
534 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  27.56 
 
 
643 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  31.41 
 
 
553 aa  187  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  28.48 
 
 
561 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  30.22 
 
 
531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  24.75 
 
 
556 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  31.75 
 
 
512 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  24.58 
 
 
556 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  32.39 
 
 
543 aa  181  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  28.7 
 
 
575 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  28.84 
 
 
541 aa  180  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1641  gamma-glutamyltransferase 2  32.89 
 
 
542 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  25.57 
 
 
604 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  32.5 
 
 
574 aa  178  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  28.24 
 
 
575 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  31.4 
 
 
568 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  32.02 
 
 
557 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  29.98 
 
 
580 aa  177  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 
557 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  29.79 
 
 
587 aa  177  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  32.02 
 
 
557 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  29.38 
 
 
545 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  29.22 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  29.77 
 
 
587 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  28.82 
 
 
576 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  31.84 
 
 
557 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  31.84 
 
 
557 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  31.84 
 
 
557 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  28.57 
 
 
575 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  31.73 
 
 
546 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  31.84 
 
 
557 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  27.89 
 
 
576 aa  173  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  29.45 
 
 
529 aa  173  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  30.15 
 
 
539 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  29.61 
 
 
533 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  27.57 
 
 
592 aa  171  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  29.15 
 
 
536 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  31.13 
 
 
634 aa  170  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  27.7 
 
 
583 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0909  gamma-glutamyltransferase 1  27.76 
 
 
590 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.591211  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  27.17 
 
 
590 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0321  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  28.78 
 
 
589 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  27.96 
 
 
587 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  28.85 
 
 
581 aa  169  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  30.84 
 
 
539 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.45 
 
 
531 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  27.67 
 
 
599 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  31.48 
 
 
546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1569  gamma-glutamyltransferase  30.39 
 
 
529 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  30 
 
 
537 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  31.4 
 
 
540 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  27.55 
 
 
602 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  27.3 
 
 
582 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  32.81 
 
 
588 aa  166  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  30.6 
 
 
526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  28.3 
 
 
576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>