More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3965 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 609 aa  1234    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  68.9 
 
 		 613 aa  844    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  85.39 
 
 		 624 aa  1061    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  53.62 
 
 		 600 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  52.71 
 
 		 599 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  52.22 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  51.56 
 
 		 594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  53.62 
 
 		 607 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  49.84 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  53.02 
 
 		 594 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  49.67 
 
 		 593 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  55.45 
 
 		 593 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  54.08 
 
 		 597 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  51.72 
 
 		 592 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  50.32 
 
 		 616 aa  539  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  49.35 
 
 		 601 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  48.22 
 
 		 615 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  50.16 
 
 		 612 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 		 601 aa  480  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  33.92 
 
 		 564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  32.75 
 
 		 570 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 		 570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 		 568 aa  259  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 		 570 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  32.34 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  32.93 
 
 		 570 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  32.93 
 
 		 570 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  32.93 
 
 		 570 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  32.17 
 
 		 545 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  32.57 
 
 		 563 aa  250  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  34.09 
 
 		 573 aa  249  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  33.93 
 
 		 586 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  31.22 
 
 		 642 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  30.96 
 
 		 563 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  33 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  30.55 
 
 		 643 aa  230  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.4 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  32.54 
 
 		 593 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  31.15 
 
 		 590 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.15 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  29.42 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  30.28 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.86 
 
 		 533 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  29.95 
 
 		 541 aa  203  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.04 
 
 		 565 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  30.88 
 
 		 536 aa  199  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  30.98 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  27.5 
 
 		 561 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  28.29 
 
 		 601 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  29.02 
 
 		 512 aa  189  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  30.19 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  30.15 
 
 		 538 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.55 
 
 		 586 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  31.06 
 
 		 531 aa  183  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  29.75 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  30.39 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  30.27 
 
 		 531 aa  181  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  30.12 
 
 		 543 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  27.84 
 
 		 581 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.52 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  29.06 
 
 		 553 aa  177  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  29.6 
 
 		 576 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  29.24 
 
 		 529 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  30.74 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1726  Gamma-glutamyltransferase  29.32 
 
 		 538 aa  173  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.855125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  29.66 
 
 		 538 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  27.19 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  27.37 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0042  gamma-glutamyltransferase  28.6 
 
 		 558 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  26.73 
 
 		 530 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  25.31 
 
 		 583 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  29.17 
 
 		 568 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  24.53 
 
 		 539 aa  166  9e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2514  gamma-glutamyltransferase 1  30.22 
 
 		 588 aa  166  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.25139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  26.48 
 
 		 592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1303  gamma-glutamyltransferase 1  28.75 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0166122  normal  0.0393824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  29.7 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.23 
 
 		 597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  26.22 
 
 		 534 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4154  gamma-glutamyltransferase 2  28.84 
 
 		 531 aa  165  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3867  Gamma-glutamyltransferase  27.76 
 
 		 535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.79604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  31.47 
 
 		 542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0011  Gamma-glutamyltransferase  28.84 
 
 		 531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  27.8 
 
 		 583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  30.85 
 
 		 529 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  28.31 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  27.23 
 
 		 592 aa  163  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4194  gamma-glutamyltransferase  30.73 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.658793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  26.42 
 
 		 537 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  26.77 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  29.7 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  27.05 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02192  gamma-glutamyltranspeptidase  27.56 
 
 		 580 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  27.77 
 
 		 599 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  30.66 
 
 		 562 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  27.46 
 
 		 534 aa  161  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  28.49 
 
 		 620 aa  161  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  28.55 
 
 		 525 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  29.67 
 
 		 526 aa  160  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>