53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7138 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  45.45 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  44.08 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  42.96 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  37.58 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  38.28 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  35.53 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  34.78 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  37.01 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  37.09 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.33 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  34.69 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  31.79 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2272  putative phage terminase, small subunit, P27 family  32.85 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621935  hitchhiker  0.0000000000000114171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2268  putative phage terminase, small subunit, P27 family  33.58 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.753219  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  32.65 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  32.08 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  31.25 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  32.33 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.82 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  28.86 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  34.65 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  30.28 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0390  hypothetical protein  33.09 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.66 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2844  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0426152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  26.72 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  28.99 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  25.86 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  27.39 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  29.2 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0956  P27 family phage terminase small subunit  30.21 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1242  hypothetical protein  28.68 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00220491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.97 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.04 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0016  phage terminase, small subunit, P27 family  22.75 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1651  P27 family phage terminase small subunit  26.09 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  29.9 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.87 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  26.24 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1338  P27 family phage terminase small subunit  24.16 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1093  hypothetical protein  29.25 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  29.91 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  29.91 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.7 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1640  hypothetical protein  26.47 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1659  putative phage terminase, small subunit, P27 family  26.03 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7333  phage terminase, small subunit, , P27 family  26.32 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1120  P27 family phage terminase small subunit  22.13 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  30.17 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1314  Phage terminase small subunit-like protein  26.36 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1698  Phage terminase small subunit-like protein  26.36 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2274  Phage terminase small subunit-like protein  26.36 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>