45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0334 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  97.81 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  80.29 
 
 		 138 aa  227  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  38.06 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  37.61 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  38.53 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  37.38 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  37.07 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  34.88 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  32.48 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  35.71 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  33.87 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  33.67 
 
 		 161 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.77 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  31.4 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  31.25 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  31.73 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.4 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  26.45 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  30.77 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  30.77 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  29.41 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2268  putative phage terminase, small subunit, P27 family  30.97 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.753219  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  25.21 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  26.45 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  36 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  25.95 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1120  P27 family phage terminase small subunit  28.83 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  28.04 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  28.7 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2272  putative phage terminase, small subunit, P27 family  30.09 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621935  hitchhiker  0.0000000000000114171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  33.62 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  25.93 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1314  Phage terminase small subunit-like protein  22.12 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1698  Phage terminase small subunit-like protein  22.12 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2274  Phage terminase small subunit-like protein  22.12 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  32.08 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  26.13 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  26.73 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1651  P27 family phage terminase small subunit  30.39 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  29.41 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2615  hypothetical protein  29.67 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1650  Phage terminase, small subunit  22.4 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4280  hypothetical protein  29.67 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>