53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0871 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  100 
 
 		 152 aa  315  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  49.68 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  45.14 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  43.66 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  37.58 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  42.97 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  32.26 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.33 
 
 		 163 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  31.82 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.95 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  39.22 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  33.99 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  31.13 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  31.1 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  36.22 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  28 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  29.06 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7333  phage terminase, small subunit, , P27 family  34.01 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1659  putative phage terminase, small subunit, P27 family  33.12 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  29.73 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  28.67 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.65 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  30.6 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  31.73 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  34.51 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  32.79 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  29.81 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  32.46 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.33 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  30.33 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  35.64 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.33 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  26.23 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  23.89 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0956  P27 family phage terminase small subunit  30.63 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  29.55 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  32.04 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2272  putative phage terminase, small subunit, P27 family  27.7 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621935  hitchhiker  0.0000000000000114171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2268  putative phage terminase, small subunit, P27 family  28.99 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.753219  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  27.54 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  27.54 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1630  hypothetical protein  28.37 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.56 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1588  putative phage terminase, small subunit  22.95 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0296354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1651  P27 family phage terminase small subunit  30.21 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1650  Phage terminase, small subunit  20.54 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3316  putative terminase small subunit  26.42 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000140314 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1078  phage terminase small subunit putative P27  25.27 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1120  P27 family phage terminase small subunit  24.11 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1058  phage terminase, small subunit, putative, P27  25.27 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  23.45 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  28.07 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>