43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1678 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2272  putative phage terminase, small subunit, P27 family  48.77 
 
 		 164 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621935  hitchhiker  0.0000000000000114171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2268  putative phage terminase, small subunit, P27 family  49.38 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.753219  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1651  P27 family phage terminase small subunit  42.62 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  35.53 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  34.87 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  29.8 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  30.86 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  34.78 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  36.73 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  35.66 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  28 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  33.67 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  33.61 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  30.72 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  28.57 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  28.95 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  31.34 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.06 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.05 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.74 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  33.02 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1120  P27 family phage terminase small subunit  30.7 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  30.21 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  29.17 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0956  P27 family phage terminase small subunit  34.12 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  27.35 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2603  P27 family phage terminase small subunit  28.32 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  24.49 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3398  P27 family phage terminase small subunit  28.36 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.096573  hitchhiker  0.0000000756325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  32.29 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1650  Phage terminase, small subunit  25.73 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  27.08 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  27.08 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  28.76 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  25.95 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  26.57 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1338  P27 family phage terminase small subunit  29.61 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  32.5 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0644  hypothetical protein  54.29 
 
 		 39 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  27.68 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  27.84 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  22.95 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>