43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1617 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  100 
 
 		 131 aa  263  7e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  96.69 
 
 		 131 aa  239  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  53.57 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  51.43 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  53.23 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  44.7 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  47.33 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  47.33 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  38.26 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  37.93 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  37.93 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  34.38 
 
 		 145 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  31.25 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  31.06 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  30.53 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  30.21 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  33.04 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  31.82 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  31.07 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  31.5 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  35.24 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  30.91 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0956  P27 family phage terminase small subunit  35.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.67 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  29.91 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  31.09 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  29.73 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  29.91 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  33.04 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  36.89 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  36.89 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1314  Phage terminase small subunit-like protein  26.09 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1698  Phage terminase small subunit-like protein  26.09 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2274  Phage terminase small subunit-like protein  26.09 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1615  P27 family phage terminase small subunit  30.19 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.415923  normal  0.344261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  27.2 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  30 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1120  P27 family phage terminase small subunit  27.42 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  26.04 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  31.25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1630  hypothetical protein  28.57 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0220  phage terminase, small subunit, , P27 family  29.9 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.23 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>